L'Inde a séquencé 89 860 échantillons entre janvier et avril, selon le dernier bulletin. Le total est maintenant de 240 570 échantillons séquencés
Le consortium indien SARS-CoV-2 sur la génomique (INSACOG) – un consortium de 38 laboratoires de séquençage du génome – a publié un bulletin hebdomadaire dans la soirée du 27 avril 2022, après une interruption de trois mois.
La mise à jour a noté que "très peu de variantes recombinantes ont été découvertes en Inde". Le dernier bulletin, paru le 10 janvier, avait noté qu'omicron était en transmission communautaire en Inde et était dominant dans ses villes métropolitaines.
La cinquième variante préoccupante était responsable de la troisième vague de COVID-19 en Inde où les cas quotidiens ont franchi la barre des 300 000 après huit mois en janvier 2022.
Cependant, le ministère de la Santé et du Bien-être familial de l'Union n'a, jusqu'à présent, jamais officiellement déclaré que le virus SARS-CoV-2 était en transmission communautaire.
L'Inde a séquencé 89 860 échantillons entre janvier et avril, selon le dernier bulletin. Le total est maintenant de 240 570 échantillons séquencés. Le nombre total de cas de COVID-19 en Inde le 28 avril 2022 était de 43 068 799.
La majorité d'entre eux viennent du Maharashtra (27,1%) et du Kerala (8,9%) - une tendance qui est restée constante tout au long de la pandémie en Inde. Ces deux États sont également les seuls à disposer de leurs propres systèmes de surveillance du génome.
"Jusqu'à présent, aucun n'a montré une transmission accrue (locale ou autre) ou associée à une maladie grave ou à une hospitalisation. Les incidences de recombinants suspects et leur éventuelle pertinence pour la santé publique sont étroitement surveillées », a noté l'organisme dans son dernier bulletin.
Les médias ont noté que BA.12 - une autre sous-variante d'omicron - a été trouvé dans le Patna du Bihar, qui est 10 fois plus dangereux que son parent qui a provoqué la troisième vague.
L'organisme de séquençage a été créé en décembre 2020 et a publié son premier bulletin en juin 2021. L'un de ses rôles clés était de « surveiller les variations génomiques du SRAS-CoV-2 pour une corrélation génomique, épidémiologique et clinique afin d'aider la réponse de santé publique à la pandémie ». .”
Le Premier ministre Narendra Modi, lors de sa rencontre avec les ministres en chef le 27 avril, a même exhorté les gouvernements des États à intensifier leurs efforts de séquençage pour garantir que les variantes sont suivies efficacement face à l'augmentation des cas. Cependant, la performance de l'Inde sur ce front est constamment restée médiocre.
L'Inde n'avait séquencé que 0,2% du total des cas signalés en septembre de l'année dernière, l'un des plus bas au monde. Avance rapide jusqu'à aujourd'hui et peu de choses ont changé.
L'Inde n'a séquencé que 0,397% de ses cas totaux. C'est selon les dernières données disponibles sur l'Initiative mondiale sur le partage des données sur la grippe aviaire (GISAID) - la plus grande base de données au monde de nouvelles séquences de génomes de coronavirus.
Plusieurs pays africains ont séquencé une plus grande part de leurs cas totaux que l'Inde. Il s'agit notamment du Kenya (2,75%), du Niger (2,9%), du Nigeria (2,2%) et de l'Afrique du Sud (1,01%) parmi plusieurs autres.
Gaurav Sharma, expert en génomique microbienne à l'Institut de bioinformatique et de biotechnologie appliquée de Bengaluru, a analysé si les pays ont amélioré leurs efforts de séquençage du génome dans un article publié ce mois-ci dans Frontières.
Ses conclusions ont révélé que l'Inde avait amélioré le délai de soumission des échantillons séquencés à 66 jours en 2021, contre 159 jours en 2020.
Le changement de 2,5 fois est une amélioration significative. Mais nous sommes loin derrière les États-Unis, le Royaume-Uni et l'Allemagne, qui ont amélioré leur retard avec une plus grande marge - respectivement 156 à 23 jours, 26 à 9 jours et 196 à 15 jours.
Le classement de l'efficacité du séquençage de l'Inde est passé à 121 en 2021, contre 125 en 2020. Mais son classement avec décalage temporel est tombé à 129 en 2021, contre 104 en 2020, uniquement parce que d'autres pays ont remarquablement amélioré leurs efforts.
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